Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc90bQ8C3X2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc90bQ8C3X2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms