Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2K1

Def6, Differentially expressed in FDCP 6, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def6Q8C2K1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Def6Q8C2K1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Def6Q8C2K1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Def6Q8C2K1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Def6Q8C2K1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Def6Q8C2K1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Def6Q8C2K1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms