Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa22Q8C1N8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa22Q8C1N8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa22Q8C1N8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms