Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrd1Q8C0R9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrd1Q8C0R9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrd1Q8C0R9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrd1Q8C0R9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrd1Q8C0R9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrd1Q8C0R9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms