Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp37Q8C0R0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp37Q8C0R0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp37Q8C0R0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms