Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim47Q8C0E3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim47Q8C0E3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim47Q8C0E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim47Q8C0E3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms