Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nhlrc2Q8BZW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlrc2Q8BZW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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