Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms