Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skor1Q8BX46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skor1Q8BX46 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skor1Q8BX46 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms