Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp5Q8BX09 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp5Q8BX09 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp5Q8BX09 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms