Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Triml1Q8BVP1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Triml1Q8BVP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms