Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rd3Q8BRE0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rd3Q8BRE0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rd3Q8BRE0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms