Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLQ7

Slc7a4, Cationic amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a4Q8BLQ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc7a4Q8BLQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc7a4Q8BLQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a4Q8BLQ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms