Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zcchc4Q8BKW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Zcchc4Q8BKW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zcchc4Q8BKW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms