Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan9Q8BJU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan9Q8BJU2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan9Q8BJU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms