Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp1Q8BJQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp1Q8BJQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms