Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbfox3Q8BIF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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