Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vipas39Q8BGQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vipas39Q8BGQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vipas39Q8BGQ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms