Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npas4Q8BGD7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Npas4Q8BGD7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms