Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dusp4Q8BFV3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dusp4Q8BFV3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dusp4Q8BFV3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms