Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.5Q85ZW7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.5Q85ZW7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms