Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Liat1Q810M6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Liat1Q810M6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms