Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem39bQ810L4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem39bQ810L4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms