Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk9Q80W65 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Pcsk9Q80W65 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk9Q80W65 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms