Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WhrnQ80VW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WhrnQ80VW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WhrnQ80VW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms