Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ell3Q80VR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ell3Q80VR2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ell3Q80VR2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Ell3Q80VR2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ell3Q80VR2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ell3Q80VR2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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