Protein–RNA interactions for Protein: Q80VA5

Sh3tc2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc2Q80VA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3tc2Q80VA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc2Q80VA5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms