Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sestd1Q80UK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sestd1Q80UK0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms