Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll4Q80UG8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll4Q80UG8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll4Q80UG8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttll4Q80UG8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttll4Q80UG8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttll4Q80UG8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttll4Q80UG8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms