Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Avl9Q80U56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Avl9Q80U56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Avl9Q80U56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms