Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2q1Q7TSS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2q1Q7TSS2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2q1Q7TSS2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms