Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctdp1Q7TSG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctdp1Q7TSG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctdp1Q7TSG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms