Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LnpkQ7TQ95 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LnpkQ7TQ95 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LnpkQ7TQ95 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms