Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raver2Q7TPD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raver2Q7TPD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raver2Q7TPD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms