Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp397Q7TNK4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp397Q7TNK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp397Q7TNK4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms