Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ScocQ78YZ6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ScocQ78YZ6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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