Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GypcQ78HU7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GypcQ78HU7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GypcQ78HU7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms