Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl35Q6ZWV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl35Q6ZWV7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl35Q6ZWV7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms