Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
March6Q6ZQ89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March6Q6ZQ89 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March6Q6ZQ89 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms