Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
NinlQ6ZQ12 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NinlQ6ZQ12 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NinlQ6ZQ12 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NinlQ6ZQ12 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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