Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smpd4Q6ZPR5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smpd4Q6ZPR5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smpd4Q6ZPR5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms