Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LcorQ6ZPI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LcorQ6ZPI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LcorQ6ZPI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms