Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdf1Q6PIX5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdf1Q6PIX5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 505.6 ms