Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc4Q6PHQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc4Q6PHQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms