Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmeff1Q6PFE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmeff1Q6PFE7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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