Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vstm2lQ6PDS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms