Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp49Q6P9L4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp49Q6P9L4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp49Q6P9L4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms