Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X6

Usp50, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp50Q6P8X6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp50Q6P8X6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp50Q6P8X6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp50Q6P8X6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp50Q6P8X6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms