Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sik3Q6P4S6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sik3Q6P4S6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik3Q6P4S6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms