Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3D0

Nudt16, U8 snoRNA-decapping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt16Q6P3D0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudt16Q6P3D0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudt16Q6P3D0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudt16Q6P3D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms